Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSPO2Q5TGU0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSPO2Q5TGU0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms