Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms