Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POU5F1Q01860 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POU5F1Q01860 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms