Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL2P13500 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL2P13500 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL2P13500 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL2P13500 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL2P13500 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL2P13500 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL2P13500 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms