Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC78A2IDD5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms