Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP25-1Q3LHN0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms