RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

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Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.79■■■■■ 4.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.71■■■■□ 3.31
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.5■■■■□ 3.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.81■■■■□ 3.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.2■■■■□ 3.07
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.89■■■■□ 3.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.79■■■■□ 3
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCRIBQ14160 1630 aa33.4■■■□□ 2.94
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCC9O60706 1549 aa33.32■■■□□ 2.92
AFG3L1P-217ENST00000557444 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.96■■■□□ 2.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 NACADO15069 1562 aa32.86■■■□□ 2.85
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.78■■■□□ 2.84
AFG3L1P-217ENST00000557444 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.75■■■□□ 2.83
AFG3L1P-217ENST00000557444 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.69■■■□□ 2.82
AFG3L1P-217ENST00000557444 HRCP23327 699 aa32.64■■■□□ 2.82
AFG3L1P-217ENST00000557444 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.54■■■□□ 2.8
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM41Q8WV44 630 aa32.5■■■□□ 2.79
AFG3L1P-217ENST00000557444 WIZO95785 1651 aa32.38■■■□□ 2.77
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.77
AFG3L1P-217ENST00000557444 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.13■■■□□ 2.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
AFG3L1P-217ENST00000557444 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.98■■■□□ 2.71
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMARCA4P51532 1647 aa31.86■■■□□ 2.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.7■■■□□ 2.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.7■■■□□ 2.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMARCA2P51531 1590 aa31.65■■■□□ 2.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCC8Q09428 1581 aa31.65■■■□□ 2.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.56■■■□□ 2.64
AFG3L1P-217ENST00000557444 SOGA1O94964 1423 aa31.32■■■□□ 2.6
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
AFG3L1P-217ENST00000557444 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.2■■■□□ 2.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.19■■■□□ 2.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP162Q5TB80 1403 aa31.09■■■□□ 2.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.08■■■□□ 2.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.07■■■□□ 2.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.05■■■□□ 2.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.99■■■□□ 2.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 EEA1Q15075 1411 aa30.99■■■□□ 2.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYNJ1O43426 1573 aa30.94■■■□□ 2.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 GOLGA3Q08378 1498 aa30.84■■■□□ 2.53
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.67■■■□□ 2.5
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF21BO75037 1637 aa30.62■■■□□ 2.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.55■■■□□ 2.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLIP1P30622 1438 aa30.52■■■□□ 2.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 TOP2BQ02880 1626 aa30.51■■■□□ 2.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 NCAPD3P42695 1498 aa30.44■■■□□ 2.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 HMGXB3Q12766 1538 aa30.4■■■□□ 2.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.39■■■□□ 2.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.36■■■□□ 2.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 CUX1P39880 1505 aa30.28■■■□□ 2.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 APLP2Q06481 763 aa30.21■■■□□ 2.43
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRXQ9BXM0 1461 aa30.2■■■□□ 2.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 CFTRP13569 1480 aa30.19■■■□□ 2.42
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.13■■■□□ 2.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF27Q86VH2 1401 aa30.07■■■□□ 2.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARAP1Q96P48 1450 aa30.06■■■□□ 2.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
AFG3L1P-217ENST00000557444 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRDM2Q13029 1718 aa29.9■■■□□ 2.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.88■■■□□ 2.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 CUX2O14529 1486 aa29.85■■■□□ 2.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.82■■■□□ 2.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 NEUROD1Q13562 356 aa29.8■■■□□ 2.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGF1RP08069 1367 aa29.8■■■□□ 2.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.78■■■□□ 2.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.76■■■□□ 2.35
AFG3L1P-217ENST00000557444 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.66■■■□□ 2.34
AFG3L1P-217ENST00000557444 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
AFG3L1P-217ENST00000557444 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
AFG3L1P-217ENST00000557444 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.61■■■□□ 2.33
AFG3L1P-217ENST00000557444 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
AFG3L1P-217ENST00000557444 ITGAEP38570 1179 aa29.55■■■□□ 2.32
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.53■■■□□ 2.32
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.52■■■□□ 2.32
AFG3L1P-217ENST00000557444 MIER1Q8N108 512 aa29.52■■■□□ 2.32
AFG3L1P-217ENST00000557444 NESP48681 1621 aa29.52■■■□□ 2.32
AFG3L1P-217ENST00000557444 P3H3Q8IVL6 736 aa29.49■■■□□ 2.31
AFG3L1P-217ENST00000557444 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
AFG3L1P-217ENST00000557444 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.46■■■□□ 2.31
AFG3L1P-217ENST00000557444 TIAM1Q13009 1591 aa29.44■■■□□ 2.3
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.44■■■□□ 2.3
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.42■■■□□ 2.3
AFG3L1P-217ENST00000557444 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
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