RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.92■■■■□ 3.66
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.64■■■□□ 2.82
RALGPS1-208ENST00000424082 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
RALGPS1-208ENST00000424082 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.82■■■□□ 2.69
RALGPS1-208ENST00000424082 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.54■■■□□ 2.64
RALGPS1-208ENST00000424082 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.15■■■□□ 2.58
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCC9O60706 1549 aa30.85■■■□□ 2.53
RALGPS1-208ENST00000424082 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.66■■■□□ 2.5
RALGPS1-208ENST00000424082 HRCP23327 699 aa30.62■■■□□ 2.49
RALGPS1-208ENST00000424082 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.62■■■□□ 2.49
RALGPS1-208ENST00000424082 SCRIBQ14160 1630 aa30.41■■■□□ 2.46
RALGPS1-208ENST00000424082 NACADO15069 1562 aa30.35■■■□□ 2.45
RALGPS1-208ENST00000424082 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.12■■■□□ 2.41
RALGPS1-208ENST00000424082 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.02■■■□□ 2.4
RALGPS1-208ENST00000424082 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
RALGPS1-208ENST00000424082 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.81■■■□□ 2.36
RALGPS1-208ENST00000424082 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
RALGPS1-208ENST00000424082 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.62■■■□□ 2.33
RALGPS1-208ENST00000424082 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.57■■■□□ 2.32
RALGPS1-208ENST00000424082 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.44■■■□□ 2.3
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
RALGPS1-208ENST00000424082 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.32■■■□□ 2.28
RALGPS1-208ENST00000424082 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.25■■■□□ 2.27
RALGPS1-208ENST00000424082 WIZO95785 1651 aa29.23■■■□□ 2.27
RALGPS1-208ENST00000424082 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM41Q8WV44 630 aa29.12■■■□□ 2.25
RALGPS1-208ENST00000424082 SMARCA4P51532 1647 aa29.05■■■□□ 2.24
RALGPS1-208ENST00000424082 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
RALGPS1-208ENST00000424082 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
RALGPS1-208ENST00000424082 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.82■■■□□ 2.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.63■■■□□ 2.17
RALGPS1-208ENST00000424082 SMARCA2P51531 1590 aa28.6■■■□□ 2.17
RALGPS1-208ENST00000424082 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.56■■■□□ 2.16
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
RALGPS1-208ENST00000424082 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.5■■■□□ 2.15
RALGPS1-208ENST00000424082 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCC8Q09428 1581 aa28.27■■■□□ 2.12
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
RALGPS1-208ENST00000424082 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
RALGPS1-208ENST00000424082 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
RALGPS1-208ENST00000424082 NCAPD3P42695 1498 aa28.09■■■□□ 2.09
RALGPS1-208ENST00000424082 NEUROD1Q13562 356 aa28.05■■■□□ 2.08
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGXB3Q12766 1538 aa28.03■■■□□ 2.08
RALGPS1-208ENST00000424082 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
RALGPS1-208ENST00000424082 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP162Q5TB80 1403 aa27.93■■■□□ 2.06
RALGPS1-208ENST00000424082 SOGA1O94964 1423 aa27.9■■■□□ 2.06
RALGPS1-208ENST00000424082 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
RALGPS1-208ENST00000424082 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.85■■■□□ 2.05
RALGPS1-208ENST00000424082 SYNJ1O43426 1573 aa27.81■■■□□ 2.04
RALGPS1-208ENST00000424082 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.81■■■□□ 2.04
RALGPS1-208ENST00000424082 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.8■■■□□ 2.04
RALGPS1-208ENST00000424082 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.77■■■□□ 2.04
RALGPS1-208ENST00000424082 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.72■■■□□ 2.03
RALGPS1-208ENST00000424082 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
RALGPS1-208ENST00000424082 EEA1Q15075 1411 aa27.68■■■□□ 2.02
RALGPS1-208ENST00000424082 MYT1Q01538 1121 aa27.67■■■□□ 2.02
RALGPS1-208ENST00000424082 CFTRP13569 1480 aa27.63■■■□□ 2.01
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA3Q08378 1498 aa27.58■■■□□ 2.01
RALGPS1-208ENST00000424082 TOP2BQ02880 1626 aa27.54■■■□□ 2
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
RALGPS1-208ENST00000424082 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.47■■□□□ 1.99
RALGPS1-208ENST00000424082 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.46■■□□□ 1.99
RALGPS1-208ENST00000424082 CUX1P39880 1505 aa27.46■■□□□ 1.99
RALGPS1-208ENST00000424082 PRDM2Q13029 1718 aa27.38■■□□□ 1.97
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.37■■□□□ 1.97
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.34■■□□□ 1.97
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF21BO75037 1637 aa27.33■■□□□ 1.97
RALGPS1-208ENST00000424082 CLIP1P30622 1438 aa27.32■■□□□ 1.96
RALGPS1-208ENST00000424082 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
RALGPS1-208ENST00000424082 NESP48681 1621 aa27.27■■□□□ 1.96
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.23■■□□□ 1.95
RALGPS1-208ENST00000424082 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.22■■□□□ 1.95
RALGPS1-208ENST00000424082 MIER1Q8N108 512 aa27.21■■□□□ 1.95
RALGPS1-208ENST00000424082 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.2■■□□□ 1.94
RALGPS1-208ENST00000424082 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
RALGPS1-208ENST00000424082 APLP2Q06481 763 aa27.13■■□□□ 1.93
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF27Q86VH2 1401 aa27.1■■□□□ 1.93
RALGPS1-208ENST00000424082 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.08■■□□□ 1.93
RALGPS1-208ENST00000424082 PRXQ9BXM0 1461 aa27.05■■□□□ 1.92
RALGPS1-208ENST00000424082 CUX2O14529 1486 aa27.02■■□□□ 1.92
RALGPS1-208ENST00000424082 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.01■■□□□ 1.91
RALGPS1-208ENST00000424082 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.96■■□□□ 1.91
RALGPS1-208ENST00000424082 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.95■■□□□ 1.9
RALGPS1-208ENST00000424082 TOPBP1Q92547 1522 aa26.95■■□□□ 1.9
RALGPS1-208ENST00000424082 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.91■■□□□ 1.9
RALGPS1-208ENST00000424082 IGF1RP08069 1367 aa26.91■■□□□ 1.9
RALGPS1-208ENST00000424082 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
RALGPS1-208ENST00000424082 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
RALGPS1-208ENST00000424082 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.84■■□□□ 1.89
RALGPS1-208ENST00000424082 ARAP1Q96P48 1450 aa26.83■■□□□ 1.89
RALGPS1-208ENST00000424082 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
RALGPS1-208ENST00000424082 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms