Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMBSP08397 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HMBSP08397 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMBSP08397 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMBSP08397 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMBSP08397 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMBSP08397 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMBSP08397 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMBSP08397 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMBSP08397 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBSP08397 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBSP08397 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBSP08397 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBSP08397 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBSP08397 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMBSP08397 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMBSP08397 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBSP08397 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBSP08397 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBSP08397 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBSP08397 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBSP08397 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBSP08397 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBSP08397 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMBSP08397 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBSP08397 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBSP08397 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBSP08397 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBSP08397 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBSP08397 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBSP08397 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBSP08397 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBSP08397 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBSP08397 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMBSP08397 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMBSP08397 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBSP08397 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBSP08397 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBSP08397 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBSP08397 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBSP08397 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBSP08397 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBSP08397 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBSP08397 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMBSP08397 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms