Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAD1O00515 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAD1O00515 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAD1O00515 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAD1O00515 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAD1O00515 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LAD1O00515 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAD1O00515 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAD1O00515 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAD1O00515 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAD1O00515 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LAD1O00515 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAD1O00515 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAD1O00515 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAD1O00515 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAD1O00515 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAD1O00515 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAD1O00515 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAD1O00515 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAD1O00515 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAD1O00515 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAD1O00515 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAD1O00515 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAD1O00515 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAD1O00515 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAD1O00515 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAD1O00515 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAD1O00515 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAD1O00515 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAD1O00515 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAD1O00515 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAD1O00515 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAD1O00515 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAD1O00515 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAD1O00515 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAD1O00515 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAD1O00515 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAD1O00515 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAD1O00515 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAD1O00515 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAD1O00515 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAD1O00515 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAD1O00515 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAD1O00515 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAD1O00515 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAD1O00515 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAD1O00515 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAD1O00515 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAD1O00515 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAD1O00515 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAD1O00515 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAD1O00515 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAD1O00515 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAD1O00515 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAD1O00515 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAD1O00515 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAD1O00515 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAD1O00515 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAD1O00515 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAD1O00515 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAD1O00515 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAD1O00515 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAD1O00515 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAD1O00515 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAD1O00515 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAD1O00515 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAD1O00515 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAD1O00515 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAD1O00515 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAD1O00515 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAD1O00515 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAD1O00515 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LAD1O00515 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAD1O00515 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAD1O00515 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms