Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
INPP4AQ96PE3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
INPP4AQ96PE3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms