RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504911.1

AP002748.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AP002748.1, Length 580 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002748.1-201ENST00000504911 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.04■■■■■ 5.92
AP002748.1-201ENST00000504911 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.36■■■■■ 5.01
AP002748.1-201ENST00000504911 ABCC9O60706 1549 aa45.33■■■■■ 4.85
AP002748.1-201ENST00000504911 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.66■■■■■ 4.58
AP002748.1-201ENST00000504911 NACADO15069 1562 aa43.6■■■■■ 4.57
AP002748.1-201ENST00000504911 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.37■■■■■ 4.53
AP002748.1-201ENST00000504911 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.37■■■■■ 4.53
AP002748.1-201ENST00000504911 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
AP002748.1-201ENST00000504911 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.12■■■■■ 4.49
AP002748.1-201ENST00000504911 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.6■■■■■ 4.41
AP002748.1-201ENST00000504911 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.3■■■■■ 4.36
AP002748.1-201ENST00000504911 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.29■■■■■ 4.36
AP002748.1-201ENST00000504911 SCRIBQ14160 1630 aa42.19■■■■■ 4.34
AP002748.1-201ENST00000504911 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.98■■■■■ 4.31
AP002748.1-201ENST00000504911 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.65■■■■■ 4.26
AP002748.1-201ENST00000504911 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
AP002748.1-201ENST00000504911 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.04■■■■■ 4.16
AP002748.1-201ENST00000504911 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.78■■■■■ 4.12
AP002748.1-201ENST00000504911 SMARCA4P51532 1647 aa40.39■■■■■ 4.06
AP002748.1-201ENST00000504911 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
AP002748.1-201ENST00000504911 NCAPD3P42695 1498 aa40.22■■■■■ 4.03
AP002748.1-201ENST00000504911 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.19■■■■■ 4.03
AP002748.1-201ENST00000504911 SMARCA2P51531 1590 aa40.18■■■■■ 4.02
AP002748.1-201ENST00000504911 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.06■■■■■ 4
AP002748.1-201ENST00000504911 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.06■■■■■ 4
AP002748.1-201ENST00000504911 HMGXB3Q12766 1538 aa40.03■■■■■ 4
AP002748.1-201ENST00000504911 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
AP002748.1-201ENST00000504911 WIZO95785 1651 aa39.6■■■■□ 3.93
AP002748.1-201ENST00000504911 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
AP002748.1-201ENST00000504911 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
AP002748.1-201ENST00000504911 NESP48681 1621 aa39.19■■■■□ 3.86
AP002748.1-201ENST00000504911 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.18■■■■□ 3.86
AP002748.1-201ENST00000504911 ERCC6Q03468 1493 aa39.12■■■■□ 3.85
AP002748.1-201ENST00000504911 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.02■■■■□ 3.84
AP002748.1-201ENST00000504911 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.91■■■■□ 3.82
AP002748.1-201ENST00000504911 CUX2O14529 1486 aa38.8■■■■□ 3.8
AP002748.1-201ENST00000504911 CFTRP13569 1480 aa38.78■■■■□ 3.8
AP002748.1-201ENST00000504911 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.76■■■■□ 3.8
AP002748.1-201ENST00000504911 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.74■■■■□ 3.79
AP002748.1-201ENST00000504911 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
AP002748.1-201ENST00000504911 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.56■■■■□ 3.76
AP002748.1-201ENST00000504911 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.54■■■■□ 3.76
AP002748.1-201ENST00000504911 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.51■■■■□ 3.76
AP002748.1-201ENST00000504911 PRDM2Q13029 1718 aa38.49■■■■□ 3.75
AP002748.1-201ENST00000504911 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
AP002748.1-201ENST00000504911 WDR62O43379 1518 aa38.39■■■■□ 3.74
AP002748.1-201ENST00000504911 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
AP002748.1-201ENST00000504911 ABCC8Q09428 1581 aa37.99■■■■□ 3.67
AP002748.1-201ENST00000504911 TOPBP1Q92547 1522 aa37.93■■■■□ 3.66
AP002748.1-201ENST00000504911 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.9■■■■□ 3.66
AP002748.1-201ENST00000504911 IFT140Q96RY7 1462 aa37.75■■■■□ 3.63
AP002748.1-201ENST00000504911 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.66■■■■□ 3.62
AP002748.1-201ENST00000504911 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
AP002748.1-201ENST00000504911 CUX1P39880 1505 aa37.6■■■■□ 3.61
AP002748.1-201ENST00000504911 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
AP002748.1-201ENST00000504911 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.6
AP002748.1-201ENST00000504911 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.49■■■■□ 3.59
AP002748.1-201ENST00000504911 SOGA1O94964 1423 aa37.44■■■■□ 3.58
AP002748.1-201ENST00000504911 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
AP002748.1-201ENST00000504911 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.39■■■■□ 3.58
AP002748.1-201ENST00000504911 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.34■■■■□ 3.57
AP002748.1-201ENST00000504911 WDR97A6NE52 1622 aa37.32■■■■□ 3.57
AP002748.1-201ENST00000504911 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.29■■■■□ 3.56
AP002748.1-201ENST00000504911 TOP2BQ02880 1626 aa37.28■■■■□ 3.56
AP002748.1-201ENST00000504911 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.28■■■■□ 3.56
AP002748.1-201ENST00000504911 SYNJ1O43426 1573 aa37.22■■■■□ 3.55
AP002748.1-201ENST00000504911 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
AP002748.1-201ENST00000504911 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.16■■■■□ 3.54
AP002748.1-201ENST00000504911 OSCARQ8IYS5 282 aa37.12■■■■□ 3.53
AP002748.1-201ENST00000504911 GRIN2BQ13224 1484 aa37.04■■■■□ 3.52
AP002748.1-201ENST00000504911 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.01■■■■□ 3.52
AP002748.1-201ENST00000504911 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.01■■■■□ 3.52
AP002748.1-201ENST00000504911 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
AP002748.1-201ENST00000504911 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.97■■■■□ 3.51
AP002748.1-201ENST00000504911 PBRM1Q86U86 1689 aa36.94■■■■□ 3.5
AP002748.1-201ENST00000504911 CHD1O14646 1710 aa36.93■■■■□ 3.5
AP002748.1-201ENST00000504911 FBLN2P98095 1184 aa36.83■■■■□ 3.49
AP002748.1-201ENST00000504911 SYNJ2O15056 1496 aa36.82■■■■□ 3.48
AP002748.1-201ENST00000504911 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
AP002748.1-201ENST00000504911 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.73■■■■□ 3.47
AP002748.1-201ENST00000504911 ADAMTS12P58397 1594 aa36.66■■■■□ 3.46
AP002748.1-201ENST00000504911 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.6■■■■□ 3.45
AP002748.1-201ENST00000504911 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.58■■■■□ 3.45
AP002748.1-201ENST00000504911 KIF27Q86VH2 1401 aa36.58■■■■□ 3.45
AP002748.1-201ENST00000504911 GRIN2AQ12879 1464 aa36.56■■■■□ 3.44
AP002748.1-201ENST00000504911 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.53■■■■□ 3.44
AP002748.1-201ENST00000504911 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.53■■■■□ 3.44
AP002748.1-201ENST00000504911 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.53■■■■□ 3.44
AP002748.1-201ENST00000504911 ARHGEF11O15085 1522 aa36.53■■■■□ 3.44
AP002748.1-201ENST00000504911 NUP160Q12769 1436 aa36.42■■■■□ 3.42
AP002748.1-201ENST00000504911 IGF1RP08069 1367 aa36.41■■■■□ 3.42
AP002748.1-201ENST00000504911 CUL7Q14999 1698 aa36.38■■■■□ 3.41
AP002748.1-201ENST00000504911 CEP170Q5SW79 1584 aa36.36■■■■□ 3.41
AP002748.1-201ENST00000504911 TRIM41Q8WV44 630 aa36.33■■■■□ 3.41
AP002748.1-201ENST00000504911 ARAP1Q96P48 1450 aa36.23■■■■□ 3.39
AP002748.1-201ENST00000504911 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.2■■■■□ 3.39
AP002748.1-201ENST00000504911 SHROOM2Q13796 1616 aa36.16■■■■□ 3.38
AP002748.1-201ENST00000504911 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.13■■■■□ 3.37
AP002748.1-201ENST00000504911 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.13■■■■□ 3.37
AP002748.1-201ENST00000504911 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms