Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HSPB3Q12988 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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