Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
DYNC1LI1Q9Y6G9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DYNC1LI1Q9Y6G9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DYNC1LI1Q9Y6G9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DYNC1LI1Q9Y6G9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DYNC1LI1Q9Y6G9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DYNC1LI1Q9Y6G9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DYNC1LI1Q9Y6G9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DYNC1LI1Q9Y6G9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DYNC1LI1Q9Y6G9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DYNC1LI1Q9Y6G9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DYNC1LI1Q9Y6G9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DYNC1LI1Q9Y6G9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DYNC1LI1Q9Y6G9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DYNC1LI1Q9Y6G9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DYNC1LI1Q9Y6G9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms