Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB5Q9Y5E4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB5Q9Y5E4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB5Q9Y5E4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB5Q9Y5E4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHB5Q9Y5E4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB5Q9Y5E4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB5Q9Y5E4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB5Q9Y5E4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHB5Q9Y5E4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHB5Q9Y5E4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB5Q9Y5E4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB5Q9Y5E4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB5Q9Y5E4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB5Q9Y5E4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB5Q9Y5E4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB5Q9Y5E4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB5Q9Y5E4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB5Q9Y5E4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB5Q9Y5E4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB5Q9Y5E4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB5Q9Y5E4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB5Q9Y5E4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB5Q9Y5E4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB5Q9Y5E4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB5Q9Y5E4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB5Q9Y5E4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB5Q9Y5E4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB5Q9Y5E4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB5Q9Y5E4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB5Q9Y5E4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB5Q9Y5E4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB5Q9Y5E4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB5Q9Y5E4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB5Q9Y5E4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB5Q9Y5E4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB5Q9Y5E4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB5Q9Y5E4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB5Q9Y5E4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB5Q9Y5E4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB5Q9Y5E4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB5Q9Y5E4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB5Q9Y5E4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB5Q9Y5E4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB5Q9Y5E4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB5Q9Y5E4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB5Q9Y5E4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB5Q9Y5E4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB5Q9Y5E4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB5Q9Y5E4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB5Q9Y5E4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB5Q9Y5E4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB5Q9Y5E4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB5Q9Y5E4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB5Q9Y5E4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB5Q9Y5E4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB5Q9Y5E4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCDHB5Q9Y5E4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB5Q9Y5E4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB5Q9Y5E4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB5Q9Y5E4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB5Q9Y5E4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB5Q9Y5E4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB5Q9Y5E4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB5Q9Y5E4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB5Q9Y5E4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB5Q9Y5E4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB5Q9Y5E4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB5Q9Y5E4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms