Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KIF3AQ9Y496 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KIF3AQ9Y496 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KIF3AQ9Y496 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIF3AQ9Y496 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KIF3AQ9Y496 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KIF3AQ9Y496 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIF3AQ9Y496 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIF3AQ9Y496 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIF3AQ9Y496 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIF3AQ9Y496 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KIF3AQ9Y496 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KIF3AQ9Y496 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KIF3AQ9Y496 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KIF3AQ9Y496 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KIF3AQ9Y496 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIF3AQ9Y496 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KIF3AQ9Y496 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIF3AQ9Y496 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIF3AQ9Y496 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIF3AQ9Y496 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
KIF3AQ9Y496 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIF3AQ9Y496 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIF3AQ9Y496 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIF3AQ9Y496 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIF3AQ9Y496 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
KIF3AQ9Y496 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
KIF3AQ9Y496 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
KIF3AQ9Y496 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
KIF3AQ9Y496 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KIF3AQ9Y496 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
KIF3AQ9Y496 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
KIF3AQ9Y496 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
KIF3AQ9Y496 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
KIF3AQ9Y496 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
KIF3AQ9Y496 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KIF3AQ9Y496 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIF3AQ9Y496 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIF3AQ9Y496 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
KIF3AQ9Y496 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
KIF3AQ9Y496 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
KIF3AQ9Y496 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KIF3AQ9Y496 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIF3AQ9Y496 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIF3AQ9Y496 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
KIF3AQ9Y496 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
KIF3AQ9Y496 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIF3AQ9Y496 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
KIF3AQ9Y496 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIF3AQ9Y496 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIF3AQ9Y496 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIF3AQ9Y496 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIF3AQ9Y496 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIF3AQ9Y496 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIF3AQ9Y496 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIF3AQ9Y496 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KIF3AQ9Y496 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIF3AQ9Y496 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIF3AQ9Y496 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KIF3AQ9Y496 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KIF3AQ9Y496 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIF3AQ9Y496 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KIF3AQ9Y496 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
KIF3AQ9Y496 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
KIF3AQ9Y496 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KIF3AQ9Y496 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIF3AQ9Y496 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
KIF3AQ9Y496 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KIF3AQ9Y496 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms