Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFSF18Q9UNG2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF18Q9UNG2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF18Q9UNG2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF18Q9UNG2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF18Q9UNG2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF18Q9UNG2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF18Q9UNG2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF18Q9UNG2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF18Q9UNG2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF18Q9UNG2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF18Q9UNG2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF18Q9UNG2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF18Q9UNG2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF18Q9UNG2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF18Q9UNG2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF18Q9UNG2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF18Q9UNG2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF18Q9UNG2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF18Q9UNG2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF18Q9UNG2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF18Q9UNG2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF18Q9UNG2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms