Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOX13Q9UN79 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOX13Q9UN79 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SOX13Q9UN79 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOX13Q9UN79 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SOX13Q9UN79 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOX13Q9UN79 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOX13Q9UN79 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOX13Q9UN79 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOX13Q9UN79 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOX13Q9UN79 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOX13Q9UN79 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX13Q9UN79 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX13Q9UN79 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOX13Q9UN79 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOX13Q9UN79 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOX13Q9UN79 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOX13Q9UN79 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOX13Q9UN79 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOX13Q9UN79 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOX13Q9UN79 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOX13Q9UN79 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOX13Q9UN79 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX13Q9UN79 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOX13Q9UN79 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOX13Q9UN79 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX13Q9UN79 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX13Q9UN79 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX13Q9UN79 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX13Q9UN79 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX13Q9UN79 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX13Q9UN79 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOX13Q9UN79 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOX13Q9UN79 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX13Q9UN79 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX13Q9UN79 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX13Q9UN79 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX13Q9UN79 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX13Q9UN79 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX13Q9UN79 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX13Q9UN79 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX13Q9UN79 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX13Q9UN79 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SOX13Q9UN79 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX13Q9UN79 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX13Q9UN79 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX13Q9UN79 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX13Q9UN79 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX13Q9UN79 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOX13Q9UN79 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SOX13Q9UN79 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX13Q9UN79 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOX13Q9UN79 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX13Q9UN79 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOX13Q9UN79 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX13Q9UN79 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms