Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDV3Q9UKY7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDV3Q9UKY7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDV3Q9UKY7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDV3Q9UKY7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDV3Q9UKY7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDV3Q9UKY7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDV3Q9UKY7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDV3Q9UKY7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDV3Q9UKY7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDV3Q9UKY7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDV3Q9UKY7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDV3Q9UKY7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDV3Q9UKY7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDV3Q9UKY7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDV3Q9UKY7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDV3Q9UKY7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDV3Q9UKY7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDV3Q9UKY7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDV3Q9UKY7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDV3Q9UKY7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDV3Q9UKY7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDV3Q9UKY7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDV3Q9UKY7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDV3Q9UKY7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDV3Q9UKY7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDV3Q9UKY7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDV3Q9UKY7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDV3Q9UKY7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDV3Q9UKY7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDV3Q9UKY7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDV3Q9UKY7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDV3Q9UKY7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDV3Q9UKY7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDV3Q9UKY7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDV3Q9UKY7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDV3Q9UKY7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDV3Q9UKY7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDV3Q9UKY7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDV3Q9UKY7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDV3Q9UKY7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDV3Q9UKY7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDV3Q9UKY7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDV3Q9UKY7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDV3Q9UKY7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDV3Q9UKY7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDV3Q9UKY7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDV3Q9UKY7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDV3Q9UKY7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDV3Q9UKY7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDV3Q9UKY7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDV3Q9UKY7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDV3Q9UKY7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDV3Q9UKY7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDV3Q9UKY7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDV3Q9UKY7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDV3Q9UKY7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDV3Q9UKY7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDV3Q9UKY7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDV3Q9UKY7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDV3Q9UKY7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDV3Q9UKY7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDV3Q9UKY7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDV3Q9UKY7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDV3Q9UKY7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDV3Q9UKY7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDV3Q9UKY7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDV3Q9UKY7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDV3Q9UKY7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDV3Q9UKY7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDV3Q9UKY7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDV3Q9UKY7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDV3Q9UKY7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDV3Q9UKY7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDV3Q9UKY7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDV3Q9UKY7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDV3Q9UKY7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDV3Q9UKY7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDV3Q9UKY7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDV3Q9UKY7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDV3Q9UKY7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDV3Q9UKY7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDV3Q9UKY7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms