Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PARP4Q9UKK3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PARP4Q9UKK3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PARP4Q9UKK3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PARP4Q9UKK3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PARP4Q9UKK3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PARP4Q9UKK3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PARP4Q9UKK3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PARP4Q9UKK3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PARP4Q9UKK3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PARP4Q9UKK3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PARP4Q9UKK3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PARP4Q9UKK3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PARP4Q9UKK3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PARP4Q9UKK3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PARP4Q9UKK3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PARP4Q9UKK3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PARP4Q9UKK3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PARP4Q9UKK3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PARP4Q9UKK3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PARP4Q9UKK3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PARP4Q9UKK3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
PARP4Q9UKK3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PARP4Q9UKK3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PARP4Q9UKK3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PARP4Q9UKK3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PARP4Q9UKK3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PARP4Q9UKK3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PARP4Q9UKK3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PARP4Q9UKK3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PARP4Q9UKK3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PARP4Q9UKK3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PARP4Q9UKK3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PARP4Q9UKK3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PARP4Q9UKK3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PARP4Q9UKK3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PARP4Q9UKK3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PARP4Q9UKK3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PARP4Q9UKK3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PARP4Q9UKK3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PARP4Q9UKK3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PARP4Q9UKK3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PARP4Q9UKK3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PARP4Q9UKK3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PARP4Q9UKK3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PARP4Q9UKK3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PARP4Q9UKK3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PARP4Q9UKK3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PARP4Q9UKK3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
PARP4Q9UKK3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PARP4Q9UKK3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PARP4Q9UKK3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PARP4Q9UKK3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PARP4Q9UKK3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PARP4Q9UKK3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PARP4Q9UKK3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PARP4Q9UKK3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PARP4Q9UKK3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PARP4Q9UKK3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PARP4Q9UKK3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
PARP4Q9UKK3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PARP4Q9UKK3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PARP4Q9UKK3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PARP4Q9UKK3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PARP4Q9UKK3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
PARP4Q9UKK3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PARP4Q9UKK3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
PARP4Q9UKK3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.38
PARP4Q9UKK3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PARP4Q9UKK3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PARP4Q9UKK3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
PARP4Q9UKK3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PARP4Q9UKK3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PARP4Q9UKK3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PARP4Q9UKK3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PARP4Q9UKK3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PARP4Q9UKK3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PARP4Q9UKK3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PARP4Q9UKK3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PARP4Q9UKK3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PARP4Q9UKK3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PARP4Q9UKK3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PARP4Q9UKK3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PARP4Q9UKK3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PARP4Q9UKK3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PARP4Q9UKK3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PARP4Q9UKK3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PARP4Q9UKK3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PARP4Q9UKK3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PARP4Q9UKK3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
PARP4Q9UKK3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PARP4Q9UKK3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PARP4Q9UKK3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PARP4Q9UKK3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PARP4Q9UKK3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PARP4Q9UKK3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PARP4Q9UKK3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PARP4Q9UKK3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PARP4Q9UKK3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PARP4Q9UKK3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms