Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK12

ZNF222, Zinc finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF222Q9UK12 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF222Q9UK12 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF222Q9UK12 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF222Q9UK12 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF222Q9UK12 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF222Q9UK12 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF222Q9UK12 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF222Q9UK12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF222Q9UK12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF222Q9UK12 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF222Q9UK12 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF222Q9UK12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF222Q9UK12 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF222Q9UK12 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF222Q9UK12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF222Q9UK12 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF222Q9UK12 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF222Q9UK12 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF222Q9UK12 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF222Q9UK12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF222Q9UK12 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF222Q9UK12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF222Q9UK12 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF222Q9UK12 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF222Q9UK12 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF222Q9UK12 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF222Q9UK12 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF222Q9UK12 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF222Q9UK12 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF222Q9UK12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF222Q9UK12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF222Q9UK12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF222Q9UK12 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF222Q9UK12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF222Q9UK12 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF222Q9UK12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF222Q9UK12 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF222Q9UK12 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF222Q9UK12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF222Q9UK12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF222Q9UK12 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF222Q9UK12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF222Q9UK12 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms