Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF11Q9UIL8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF11Q9UIL8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF11Q9UIL8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF11Q9UIL8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF11Q9UIL8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF11Q9UIL8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF11Q9UIL8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF11Q9UIL8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF11Q9UIL8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF11Q9UIL8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF11Q9UIL8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF11Q9UIL8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF11Q9UIL8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF11Q9UIL8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF11Q9UIL8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF11Q9UIL8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF11Q9UIL8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF11Q9UIL8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF11Q9UIL8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF11Q9UIL8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF11Q9UIL8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF11Q9UIL8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHF11Q9UIL8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF11Q9UIL8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF11Q9UIL8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms