Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NPC1L1Q9UHC9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NPC1L1Q9UHC9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NPC1L1Q9UHC9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NPC1L1Q9UHC9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NPC1L1Q9UHC9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NPC1L1Q9UHC9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NPC1L1Q9UHC9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NPC1L1Q9UHC9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NPC1L1Q9UHC9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NPC1L1Q9UHC9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NPC1L1Q9UHC9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NPC1L1Q9UHC9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NPC1L1Q9UHC9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NPC1L1Q9UHC9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NPC1L1Q9UHC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NPC1L1Q9UHC9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NPC1L1Q9UHC9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NPC1L1Q9UHC9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
NPC1L1Q9UHC9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NPC1L1Q9UHC9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NPC1L1Q9UHC9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NPC1L1Q9UHC9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NPC1L1Q9UHC9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NPC1L1Q9UHC9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NPC1L1Q9UHC9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NPC1L1Q9UHC9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NPC1L1Q9UHC9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NPC1L1Q9UHC9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NPC1L1Q9UHC9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NPC1L1Q9UHC9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NPC1L1Q9UHC9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NPC1L1Q9UHC9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NPC1L1Q9UHC9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NPC1L1Q9UHC9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NPC1L1Q9UHC9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NPC1L1Q9UHC9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NPC1L1Q9UHC9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NPC1L1Q9UHC9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NPC1L1Q9UHC9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NPC1L1Q9UHC9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NPC1L1Q9UHC9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NPC1L1Q9UHC9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NPC1L1Q9UHC9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NPC1L1Q9UHC9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NPC1L1Q9UHC9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
NPC1L1Q9UHC9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NPC1L1Q9UHC9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NPC1L1Q9UHC9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NPC1L1Q9UHC9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NPC1L1Q9UHC9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NPC1L1Q9UHC9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NPC1L1Q9UHC9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NPC1L1Q9UHC9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NPC1L1Q9UHC9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NPC1L1Q9UHC9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NPC1L1Q9UHC9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NPC1L1Q9UHC9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NPC1L1Q9UHC9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NPC1L1Q9UHC9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NPC1L1Q9UHC9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
NPC1L1Q9UHC9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NPC1L1Q9UHC9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NPC1L1Q9UHC9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NPC1L1Q9UHC9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NPC1L1Q9UHC9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
NPC1L1Q9UHC9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NPC1L1Q9UHC9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NPC1L1Q9UHC9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms