Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL3Q9UH77 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL3Q9UH77 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL3Q9UH77 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL3Q9UH77 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL3Q9UH77 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL3Q9UH77 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL3Q9UH77 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL3Q9UH77 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL3Q9UH77 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL3Q9UH77 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL3Q9UH77 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHL3Q9UH77 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL3Q9UH77 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL3Q9UH77 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL3Q9UH77 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL3Q9UH77 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL3Q9UH77 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL3Q9UH77 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL3Q9UH77 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL3Q9UH77 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL3Q9UH77 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL3Q9UH77 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL3Q9UH77 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL3Q9UH77 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL3Q9UH77 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL3Q9UH77 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL3Q9UH77 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL3Q9UH77 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL3Q9UH77 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL3Q9UH77 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL3Q9UH77 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL3Q9UH77 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL3Q9UH77 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL3Q9UH77 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL3Q9UH77 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL3Q9UH77 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL3Q9UH77 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL3Q9UH77 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL3Q9UH77 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL3Q9UH77 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL3Q9UH77 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL3Q9UH77 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL3Q9UH77 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL3Q9UH77 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL3Q9UH77 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL3Q9UH77 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL3Q9UH77 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms