Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNOT8Q9UFF9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNOT8Q9UFF9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNOT8Q9UFF9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNOT8Q9UFF9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNOT8Q9UFF9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNOT8Q9UFF9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNOT8Q9UFF9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNOT8Q9UFF9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNOT8Q9UFF9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNOT8Q9UFF9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNOT8Q9UFF9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNOT8Q9UFF9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNOT8Q9UFF9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNOT8Q9UFF9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNOT8Q9UFF9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNOT8Q9UFF9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNOT8Q9UFF9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNOT8Q9UFF9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNOT8Q9UFF9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNOT8Q9UFF9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNOT8Q9UFF9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNOT8Q9UFF9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNOT8Q9UFF9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CNOT8Q9UFF9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNOT8Q9UFF9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNOT8Q9UFF9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNOT8Q9UFF9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNOT8Q9UFF9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNOT8Q9UFF9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNOT8Q9UFF9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNOT8Q9UFF9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNOT8Q9UFF9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNOT8Q9UFF9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNOT8Q9UFF9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNOT8Q9UFF9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNOT8Q9UFF9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNOT8Q9UFF9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNOT8Q9UFF9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CNOT8Q9UFF9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNOT8Q9UFF9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CNOT8Q9UFF9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNOT8Q9UFF9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNOT8Q9UFF9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNOT8Q9UFF9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNOT8Q9UFF9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNOT8Q9UFF9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNOT8Q9UFF9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNOT8Q9UFF9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CNOT8Q9UFF9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNOT8Q9UFF9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNOT8Q9UFF9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNOT8Q9UFF9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNOT8Q9UFF9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNOT8Q9UFF9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNOT8Q9UFF9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNOT8Q9UFF9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNOT8Q9UFF9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNOT8Q9UFF9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNOT8Q9UFF9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNOT8Q9UFF9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNOT8Q9UFF9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNOT8Q9UFF9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNOT8Q9UFF9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNOT8Q9UFF9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNOT8Q9UFF9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNOT8Q9UFF9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNOT8Q9UFF9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNOT8Q9UFF9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNOT8Q9UFF9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNOT8Q9UFF9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNOT8Q9UFF9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNOT8Q9UFF9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CNOT8Q9UFF9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNOT8Q9UFF9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNOT8Q9UFF9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNOT8Q9UFF9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNOT8Q9UFF9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNOT8Q9UFF9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNOT8Q9UFF9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNOT8Q9UFF9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNOT8Q9UFF9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNOT8Q9UFF9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNOT8Q9UFF9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CNOT8Q9UFF9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNOT8Q9UFF9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNOT8Q9UFF9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms