Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NKX1-2Q9UD57 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX1-2Q9UD57 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX1-2Q9UD57 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-2Q9UD57 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-2Q9UD57 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX1-2Q9UD57 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKX1-2Q9UD57 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKX1-2Q9UD57 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NKX1-2Q9UD57 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NKX1-2Q9UD57 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NKX1-2Q9UD57 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKX1-2Q9UD57 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NKX1-2Q9UD57 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NKX1-2Q9UD57 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX1-2Q9UD57 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKX1-2Q9UD57 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKX1-2Q9UD57 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-2Q9UD57 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX1-2Q9UD57 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-2Q9UD57 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX1-2Q9UD57 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-2Q9UD57 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-2Q9UD57 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX1-2Q9UD57 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-2Q9UD57 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-2Q9UD57 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-2Q9UD57 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX1-2Q9UD57 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NKX1-2Q9UD57 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NKX1-2Q9UD57 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX1-2Q9UD57 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX1-2Q9UD57 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX1-2Q9UD57 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX1-2Q9UD57 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-2Q9UD57 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX1-2Q9UD57 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NKX1-2Q9UD57 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-2Q9UD57 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-2Q9UD57 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-2Q9UD57 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX1-2Q9UD57 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX1-2Q9UD57 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-2Q9UD57 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-2Q9UD57 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-2Q9UD57 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX1-2Q9UD57 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX1-2Q9UD57 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX1-2Q9UD57 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX1-2Q9UD57 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX1-2Q9UD57 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX1-2Q9UD57 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms