Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC88CQ9P219 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC88CQ9P219 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC88CQ9P219 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC88CQ9P219 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC88CQ9P219 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC88CQ9P219 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC88CQ9P219 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC88CQ9P219 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC88CQ9P219 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC88CQ9P219 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC88CQ9P219 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC88CQ9P219 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC88CQ9P219 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC88CQ9P219 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC88CQ9P219 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC88CQ9P219 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC88CQ9P219 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC88CQ9P219 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC88CQ9P219 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC88CQ9P219 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC88CQ9P219 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC88CQ9P219 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC88CQ9P219 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC88CQ9P219 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC88CQ9P219 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC88CQ9P219 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC88CQ9P219 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC88CQ9P219 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC88CQ9P219 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC88CQ9P219 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC88CQ9P219 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC88CQ9P219 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC88CQ9P219 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC88CQ9P219 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC88CQ9P219 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC88CQ9P219 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC88CQ9P219 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC88CQ9P219 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC88CQ9P219 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC88CQ9P219 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms