Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PHRF1Q9P1Y6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PHRF1Q9P1Y6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PHRF1Q9P1Y6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PHRF1Q9P1Y6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PHRF1Q9P1Y6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PHRF1Q9P1Y6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PHRF1Q9P1Y6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PHRF1Q9P1Y6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PHRF1Q9P1Y6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PHRF1Q9P1Y6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PHRF1Q9P1Y6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PHRF1Q9P1Y6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PHRF1Q9P1Y6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PHRF1Q9P1Y6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PHRF1Q9P1Y6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PHRF1Q9P1Y6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
PHRF1Q9P1Y6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PHRF1Q9P1Y6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PHRF1Q9P1Y6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PHRF1Q9P1Y6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PHRF1Q9P1Y6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PHRF1Q9P1Y6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PHRF1Q9P1Y6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PHRF1Q9P1Y6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PHRF1Q9P1Y6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PHRF1Q9P1Y6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PHRF1Q9P1Y6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PHRF1Q9P1Y6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PHRF1Q9P1Y6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PHRF1Q9P1Y6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PHRF1Q9P1Y6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PHRF1Q9P1Y6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PHRF1Q9P1Y6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PHRF1Q9P1Y6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PHRF1Q9P1Y6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PHRF1Q9P1Y6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PHRF1Q9P1Y6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PHRF1Q9P1Y6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PHRF1Q9P1Y6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PHRF1Q9P1Y6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PHRF1Q9P1Y6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PHRF1Q9P1Y6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PHRF1Q9P1Y6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PHRF1Q9P1Y6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PHRF1Q9P1Y6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PHRF1Q9P1Y6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PHRF1Q9P1Y6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PHRF1Q9P1Y6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PHRF1Q9P1Y6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PHRF1Q9P1Y6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PHRF1Q9P1Y6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PHRF1Q9P1Y6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PHRF1Q9P1Y6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PHRF1Q9P1Y6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PHRF1Q9P1Y6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
PHRF1Q9P1Y6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PHRF1Q9P1Y6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PHRF1Q9P1Y6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
PHRF1Q9P1Y6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PHRF1Q9P1Y6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PHRF1Q9P1Y6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PHRF1Q9P1Y6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PHRF1Q9P1Y6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PHRF1Q9P1Y6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PHRF1Q9P1Y6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PHRF1Q9P1Y6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PHRF1Q9P1Y6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PHRF1Q9P1Y6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
PHRF1Q9P1Y6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PHRF1Q9P1Y6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
PHRF1Q9P1Y6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PHRF1Q9P1Y6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PHRF1Q9P1Y6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PHRF1Q9P1Y6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PHRF1Q9P1Y6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PHRF1Q9P1Y6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
PHRF1Q9P1Y6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PHRF1Q9P1Y6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PHRF1Q9P1Y6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PHRF1Q9P1Y6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PHRF1Q9P1Y6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
PHRF1Q9P1Y6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PHRF1Q9P1Y6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PHRF1Q9P1Y6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PHRF1Q9P1Y6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PHRF1Q9P1Y6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PHRF1Q9P1Y6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PHRF1Q9P1Y6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PHRF1Q9P1Y6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PHRF1Q9P1Y6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PHRF1Q9P1Y6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PHRF1Q9P1Y6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PHRF1Q9P1Y6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PHRF1Q9P1Y6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PHRF1Q9P1Y6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PHRF1Q9P1Y6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms