Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNAJC17Q9NVM6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNAJC17Q9NVM6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNAJC17Q9NVM6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNAJC17Q9NVM6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DNAJC17Q9NVM6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DNAJC17Q9NVM6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNAJC17Q9NVM6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNAJC17Q9NVM6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNAJC17Q9NVM6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNAJC17Q9NVM6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNAJC17Q9NVM6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNAJC17Q9NVM6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNAJC17Q9NVM6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DNAJC17Q9NVM6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNAJC17Q9NVM6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNAJC17Q9NVM6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNAJC17Q9NVM6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DNAJC17Q9NVM6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DNAJC17Q9NVM6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DNAJC17Q9NVM6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DNAJC17Q9NVM6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DNAJC17Q9NVM6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNAJC17Q9NVM6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNAJC17Q9NVM6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNAJC17Q9NVM6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAJC17Q9NVM6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAJC17Q9NVM6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DNAJC17Q9NVM6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAJC17Q9NVM6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DNAJC17Q9NVM6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNAJC17Q9NVM6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNAJC17Q9NVM6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNAJC17Q9NVM6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAJC17Q9NVM6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAJC17Q9NVM6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNAJC17Q9NVM6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAJC17Q9NVM6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAJC17Q9NVM6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNAJC17Q9NVM6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNAJC17Q9NVM6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNAJC17Q9NVM6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNAJC17Q9NVM6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNAJC17Q9NVM6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJC17Q9NVM6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNAJC17Q9NVM6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DNAJC17Q9NVM6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DNAJC17Q9NVM6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNAJC17Q9NVM6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNAJC17Q9NVM6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DNAJC17Q9NVM6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAJC17Q9NVM6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DNAJC17Q9NVM6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAJC17Q9NVM6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAJC17Q9NVM6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAJC17Q9NVM6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DNAJC17Q9NVM6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DNAJC17Q9NVM6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNAJC17Q9NVM6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAJC17Q9NVM6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAJC17Q9NVM6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAJC17Q9NVM6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAJC17Q9NVM6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAJC17Q9NVM6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNAJC17Q9NVM6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNAJC17Q9NVM6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNAJC17Q9NVM6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAJC17Q9NVM6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms