Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL5

RYDEN, Repressor of yield of DENV protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYDENQ9NUL5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RYDENQ9NUL5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RYDENQ9NUL5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RYDENQ9NUL5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RYDENQ9NUL5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RYDENQ9NUL5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RYDENQ9NUL5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RYDENQ9NUL5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RYDENQ9NUL5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RYDENQ9NUL5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RYDENQ9NUL5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RYDENQ9NUL5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RYDENQ9NUL5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RYDENQ9NUL5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RYDENQ9NUL5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RYDENQ9NUL5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RYDENQ9NUL5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RYDENQ9NUL5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RYDENQ9NUL5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYDENQ9NUL5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RYDENQ9NUL5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RYDENQ9NUL5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RYDENQ9NUL5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RYDENQ9NUL5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RYDENQ9NUL5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RYDENQ9NUL5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RYDENQ9NUL5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RYDENQ9NUL5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RYDENQ9NUL5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RYDENQ9NUL5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RYDENQ9NUL5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RYDENQ9NUL5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RYDENQ9NUL5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RYDENQ9NUL5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RYDENQ9NUL5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RYDENQ9NUL5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RYDENQ9NUL5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RYDENQ9NUL5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RYDENQ9NUL5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RYDENQ9NUL5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYDENQ9NUL5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYDENQ9NUL5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYDENQ9NUL5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RYDENQ9NUL5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RYDENQ9NUL5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RYDENQ9NUL5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RYDENQ9NUL5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RYDENQ9NUL5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RYDENQ9NUL5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYDENQ9NUL5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYDENQ9NUL5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYDENQ9NUL5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYDENQ9NUL5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYDENQ9NUL5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RYDENQ9NUL5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RYDENQ9NUL5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RYDENQ9NUL5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RYDENQ9NUL5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RYDENQ9NUL5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RYDENQ9NUL5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RYDENQ9NUL5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RYDENQ9NUL5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RYDENQ9NUL5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RYDENQ9NUL5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms