Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKDREJQ9NTG1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKDREJQ9NTG1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKDREJQ9NTG1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKDREJQ9NTG1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKDREJQ9NTG1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKDREJQ9NTG1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKDREJQ9NTG1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PKDREJQ9NTG1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKDREJQ9NTG1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PKDREJQ9NTG1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDREJQ9NTG1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDREJQ9NTG1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDREJQ9NTG1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDREJQ9NTG1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKDREJQ9NTG1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKDREJQ9NTG1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKDREJQ9NTG1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKDREJQ9NTG1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKDREJQ9NTG1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKDREJQ9NTG1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKDREJQ9NTG1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKDREJQ9NTG1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKDREJQ9NTG1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKDREJQ9NTG1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PKDREJQ9NTG1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKDREJQ9NTG1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKDREJQ9NTG1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKDREJQ9NTG1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKDREJQ9NTG1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PKDREJQ9NTG1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PKDREJQ9NTG1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKDREJQ9NTG1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKDREJQ9NTG1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKDREJQ9NTG1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKDREJQ9NTG1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKDREJQ9NTG1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKDREJQ9NTG1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKDREJQ9NTG1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDREJQ9NTG1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDREJQ9NTG1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKDREJQ9NTG1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PKDREJQ9NTG1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKDREJQ9NTG1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDREJQ9NTG1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDREJQ9NTG1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDREJQ9NTG1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKDREJQ9NTG1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDREJQ9NTG1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms