Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF19Q9NS68 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF19Q9NS68 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF19Q9NS68 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFRSF19Q9NS68 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF19Q9NS68 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF19Q9NS68 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFRSF19Q9NS68 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFRSF19Q9NS68 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF19Q9NS68 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFRSF19Q9NS68 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF19Q9NS68 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF19Q9NS68 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF19Q9NS68 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF19Q9NS68 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms