Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TOPORSQ9NS56 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOPORSQ9NS56 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPORSQ9NS56 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOPORSQ9NS56 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOPORSQ9NS56 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOPORSQ9NS56 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPORSQ9NS56 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPORSQ9NS56 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPORSQ9NS56 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOPORSQ9NS56 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPORSQ9NS56 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPORSQ9NS56 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPORSQ9NS56 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPORSQ9NS56 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPORSQ9NS56 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPORSQ9NS56 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPORSQ9NS56 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPORSQ9NS56 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOPORSQ9NS56 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPORSQ9NS56 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOPORSQ9NS56 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPORSQ9NS56 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPORSQ9NS56 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOPORSQ9NS56 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPORSQ9NS56 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TOPORSQ9NS56 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOPORSQ9NS56 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOPORSQ9NS56 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOPORSQ9NS56 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOPORSQ9NS56 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOPORSQ9NS56 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPORSQ9NS56 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPORSQ9NS56 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPORSQ9NS56 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOPORSQ9NS56 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOPORSQ9NS56 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPORSQ9NS56 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOPORSQ9NS56 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOPORSQ9NS56 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TOPORSQ9NS56 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOPORSQ9NS56 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOPORSQ9NS56 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOPORSQ9NS56 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOPORSQ9NS56 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPORSQ9NS56 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPORSQ9NS56 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TOPORSQ9NS56 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOPORSQ9NS56 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPORSQ9NS56 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPORSQ9NS56 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPORSQ9NS56 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPORSQ9NS56 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOPORSQ9NS56 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOPORSQ9NS56 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms