Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHAF3Q9NRP4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHAF3Q9NRP4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHAF3Q9NRP4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHAF3Q9NRP4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDHAF3Q9NRP4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDHAF3Q9NRP4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDHAF3Q9NRP4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDHAF3Q9NRP4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDHAF3Q9NRP4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SDHAF3Q9NRP4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDHAF3Q9NRP4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDHAF3Q9NRP4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDHAF3Q9NRP4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDHAF3Q9NRP4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDHAF3Q9NRP4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDHAF3Q9NRP4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDHAF3Q9NRP4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDHAF3Q9NRP4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDHAF3Q9NRP4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SDHAF3Q9NRP4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDHAF3Q9NRP4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDHAF3Q9NRP4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDHAF3Q9NRP4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDHAF3Q9NRP4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDHAF3Q9NRP4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDHAF3Q9NRP4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDHAF3Q9NRP4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHAF3Q9NRP4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDHAF3Q9NRP4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDHAF3Q9NRP4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDHAF3Q9NRP4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SDHAF3Q9NRP4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDHAF3Q9NRP4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms