Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
STRN4Q9NRL3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
STRN4Q9NRL3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
STRN4Q9NRL3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
STRN4Q9NRL3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
STRN4Q9NRL3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
STRN4Q9NRL3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
STRN4Q9NRL3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
STRN4Q9NRL3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
STRN4Q9NRL3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
STRN4Q9NRL3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
STRN4Q9NRL3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
STRN4Q9NRL3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
STRN4Q9NRL3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
STRN4Q9NRL3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
STRN4Q9NRL3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
STRN4Q9NRL3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
STRN4Q9NRL3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
STRN4Q9NRL3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
STRN4Q9NRL3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
STRN4Q9NRL3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
STRN4Q9NRL3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
STRN4Q9NRL3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
STRN4Q9NRL3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
STRN4Q9NRL3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRN4Q9NRL3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRN4Q9NRL3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
STRN4Q9NRL3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
STRN4Q9NRL3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
STRN4Q9NRL3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
STRN4Q9NRL3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
STRN4Q9NRL3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
STRN4Q9NRL3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
STRN4Q9NRL3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
STRN4Q9NRL3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
STRN4Q9NRL3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
STRN4Q9NRL3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
STRN4Q9NRL3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
STRN4Q9NRL3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
STRN4Q9NRL3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
STRN4Q9NRL3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
STRN4Q9NRL3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
STRN4Q9NRL3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
STRN4Q9NRL3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
STRN4Q9NRL3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRN4Q9NRL3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRN4Q9NRL3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRN4Q9NRL3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
STRN4Q9NRL3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRN4Q9NRL3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRN4Q9NRL3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
STRN4Q9NRL3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
STRN4Q9NRL3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
STRN4Q9NRL3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
STRN4Q9NRL3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
STRN4Q9NRL3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
STRN4Q9NRL3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
STRN4Q9NRL3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
STRN4Q9NRL3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
STRN4Q9NRL3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
STRN4Q9NRL3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
STRN4Q9NRL3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
STRN4Q9NRL3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
STRN4Q9NRL3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
STRN4Q9NRL3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
STRN4Q9NRL3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
STRN4Q9NRL3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
STRN4Q9NRL3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
STRN4Q9NRL3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
STRN4Q9NRL3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
STRN4Q9NRL3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
STRN4Q9NRL3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
STRN4Q9NRL3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
STRN4Q9NRL3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
STRN4Q9NRL3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
STRN4Q9NRL3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
STRN4Q9NRL3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
STRN4Q9NRL3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
STRN4Q9NRL3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
STRN4Q9NRL3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
STRN4Q9NRL3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
STRN4Q9NRL3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
STRN4Q9NRL3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
STRN4Q9NRL3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
STRN4Q9NRL3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms