Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SNRKQ9NRH2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SNRKQ9NRH2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SNRKQ9NRH2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SNRKQ9NRH2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SNRKQ9NRH2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms