Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRM3Q9NNZ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRM3Q9NNZ6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRM3Q9NNZ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRM3Q9NNZ6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRM3Q9NNZ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRM3Q9NNZ6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRM3Q9NNZ6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRM3Q9NNZ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRM3Q9NNZ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRM3Q9NNZ6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRM3Q9NNZ6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRM3Q9NNZ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRM3Q9NNZ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRM3Q9NNZ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRM3Q9NNZ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRM3Q9NNZ6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRM3Q9NNZ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRM3Q9NNZ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRM3Q9NNZ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRM3Q9NNZ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRM3Q9NNZ6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRM3Q9NNZ6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRM3Q9NNZ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRM3Q9NNZ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRM3Q9NNZ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRM3Q9NNZ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRM3Q9NNZ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRM3Q9NNZ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRM3Q9NNZ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRM3Q9NNZ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRM3Q9NNZ6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRM3Q9NNZ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRM3Q9NNZ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRM3Q9NNZ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRM3Q9NNZ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRM3Q9NNZ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRM3Q9NNZ6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRM3Q9NNZ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRM3Q9NNZ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRM3Q9NNZ6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRM3Q9NNZ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRM3Q9NNZ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRM3Q9NNZ6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRM3Q9NNZ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRM3Q9NNZ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRM3Q9NNZ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRM3Q9NNZ6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRM3Q9NNZ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRM3Q9NNZ6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRM3Q9NNZ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRM3Q9NNZ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRM3Q9NNZ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRM3Q9NNZ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRM3Q9NNZ6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRM3Q9NNZ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRM3Q9NNZ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRM3Q9NNZ6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRM3Q9NNZ6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRM3Q9NNZ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRM3Q9NNZ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRM3Q9NNZ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRM3Q9NNZ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRM3Q9NNZ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRM3Q9NNZ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRM3Q9NNZ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRM3Q9NNZ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRM3Q9NNZ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRM3Q9NNZ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRM3Q9NNZ6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRM3Q9NNZ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRM3Q9NNZ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRM3Q9NNZ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRM3Q9NNZ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRM3Q9NNZ6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRM3Q9NNZ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRM3Q9NNZ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRM3Q9NNZ6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRM3Q9NNZ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRM3Q9NNZ6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRM3Q9NNZ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRM3Q9NNZ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRM3Q9NNZ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms