Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU1

BARX1, Homeobox protein BarH-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1Q9HBU1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX1Q9HBU1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX1Q9HBU1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BARX1Q9HBU1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX1Q9HBU1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX1Q9HBU1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX1Q9HBU1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARX1Q9HBU1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX1Q9HBU1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARX1Q9HBU1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARX1Q9HBU1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARX1Q9HBU1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARX1Q9HBU1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARX1Q9HBU1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARX1Q9HBU1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARX1Q9HBU1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARX1Q9HBU1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARX1Q9HBU1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARX1Q9HBU1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARX1Q9HBU1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARX1Q9HBU1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARX1Q9HBU1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARX1Q9HBU1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BARX1Q9HBU1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BARX1Q9HBU1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BARX1Q9HBU1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BARX1Q9HBU1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BARX1Q9HBU1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BARX1Q9HBU1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BARX1Q9HBU1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARX1Q9HBU1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARX1Q9HBU1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BARX1Q9HBU1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BARX1Q9HBU1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BARX1Q9HBU1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BARX1Q9HBU1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BARX1Q9HBU1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BARX1Q9HBU1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms