Protein–RNA interactions for Protein: Q9H853

TUBA4B, Putative tubulin-like protein alpha-4B, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4BQ9H853 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA4BQ9H853 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA4BQ9H853 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA4BQ9H853 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBA4BQ9H853 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBA4BQ9H853 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBA4BQ9H853 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms