Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM12Q9H4Q4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM12Q9H4Q4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM12Q9H4Q4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM12Q9H4Q4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM12Q9H4Q4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM12Q9H4Q4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRDM12Q9H4Q4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM12Q9H4Q4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRDM12Q9H4Q4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM12Q9H4Q4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM12Q9H4Q4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM12Q9H4Q4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM12Q9H4Q4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM12Q9H4Q4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM12Q9H4Q4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM12Q9H4Q4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRDM12Q9H4Q4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM12Q9H4Q4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRDM12Q9H4Q4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM12Q9H4Q4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM12Q9H4Q4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM12Q9H4Q4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM12Q9H4Q4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM12Q9H4Q4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PRDM12Q9H4Q4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRDM12Q9H4Q4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM12Q9H4Q4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRDM12Q9H4Q4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM12Q9H4Q4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM12Q9H4Q4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM12Q9H4Q4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM12Q9H4Q4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM12Q9H4Q4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM12Q9H4Q4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM12Q9H4Q4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM12Q9H4Q4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM12Q9H4Q4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM12Q9H4Q4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM12Q9H4Q4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM12Q9H4Q4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM12Q9H4Q4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM12Q9H4Q4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRDM12Q9H4Q4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PRDM12Q9H4Q4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRDM12Q9H4Q4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRDM12Q9H4Q4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM12Q9H4Q4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM12Q9H4Q4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM12Q9H4Q4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM12Q9H4Q4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM12Q9H4Q4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM12Q9H4Q4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM12Q9H4Q4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM12Q9H4Q4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM12Q9H4Q4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM12Q9H4Q4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM12Q9H4Q4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM12Q9H4Q4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM12Q9H4Q4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM12Q9H4Q4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM12Q9H4Q4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM12Q9H4Q4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM12Q9H4Q4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM12Q9H4Q4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM12Q9H4Q4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM12Q9H4Q4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM12Q9H4Q4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM12Q9H4Q4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM12Q9H4Q4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM12Q9H4Q4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM12Q9H4Q4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM12Q9H4Q4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRDM12Q9H4Q4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms