Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF3Q9H094 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NBPF3Q9H094 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF3Q9H094 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF3Q9H094 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF3Q9H094 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF3Q9H094 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF3Q9H094 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF3Q9H094 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NBPF3Q9H094 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NBPF3Q9H094 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF3Q9H094 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF3Q9H094 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF3Q9H094 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF3Q9H094 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF3Q9H094 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF3Q9H094 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF3Q9H094 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF3Q9H094 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF3Q9H094 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF3Q9H094 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF3Q9H094 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF3Q9H094 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF3Q9H094 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF3Q9H094 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF3Q9H094 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF3Q9H094 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NBPF3Q9H094 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF3Q9H094 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF3Q9H094 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF3Q9H094 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF3Q9H094 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF3Q9H094 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF3Q9H094 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NBPF3Q9H094 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF3Q9H094 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF3Q9H094 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NBPF3Q9H094 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NBPF3Q9H094 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF3Q9H094 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF3Q9H094 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF3Q9H094 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF3Q9H094 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF3Q9H094 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF3Q9H094 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF3Q9H094 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NBPF3Q9H094 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NBPF3Q9H094 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NBPF3Q9H094 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NBPF3Q9H094 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NBPF3Q9H094 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NBPF3Q9H094 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
NBPF3Q9H094 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NBPF3Q9H094 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NBPF3Q9H094 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NBPF3Q9H094 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NBPF3Q9H094 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NBPF3Q9H094 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NBPF3Q9H094 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NBPF3Q9H094 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NBPF3Q9H094 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NBPF3Q9H094 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NBPF3Q9H094 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
NBPF3Q9H094 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NBPF3Q9H094 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NBPF3Q9H094 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
NBPF3Q9H094 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NBPF3Q9H094 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NBPF3Q9H094 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NBPF3Q9H094 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NBPF3Q9H094 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NBPF3Q9H094 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NBPF3Q9H094 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NBPF3Q9H094 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NBPF3Q9H094 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NBPF3Q9H094 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NBPF3Q9H094 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NBPF3Q9H094 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NBPF3Q9H094 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NBPF3Q9H094 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NBPF3Q9H094 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NBPF3Q9H094 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NBPF3Q9H094 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NBPF3Q9H094 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NBPF3Q9H094 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms