Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC6A16Q9GZN6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SLC6A16Q9GZN6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC6A16Q9GZN6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC6A16Q9GZN6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC6A16Q9GZN6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC6A16Q9GZN6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC6A16Q9GZN6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC6A16Q9GZN6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC6A16Q9GZN6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC6A16Q9GZN6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC6A16Q9GZN6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC6A16Q9GZN6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC6A16Q9GZN6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC6A16Q9GZN6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC6A16Q9GZN6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC6A16Q9GZN6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC6A16Q9GZN6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC6A16Q9GZN6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A16Q9GZN6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A16Q9GZN6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC6A16Q9GZN6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC6A16Q9GZN6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC6A16Q9GZN6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC6A16Q9GZN6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC6A16Q9GZN6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC6A16Q9GZN6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC6A16Q9GZN6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC6A16Q9GZN6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC6A16Q9GZN6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC6A16Q9GZN6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC6A16Q9GZN6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC6A16Q9GZN6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A16Q9GZN6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC6A16Q9GZN6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A16Q9GZN6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A16Q9GZN6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A16Q9GZN6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A16Q9GZN6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC6A16Q9GZN6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC6A16Q9GZN6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC6A16Q9GZN6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC6A16Q9GZN6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC6A16Q9GZN6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC6A16Q9GZN6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC6A16Q9GZN6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A16Q9GZN6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC6A16Q9GZN6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC6A16Q9GZN6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A16Q9GZN6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A16Q9GZN6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A16Q9GZN6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC6A16Q9GZN6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC6A16Q9GZN6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A16Q9GZN6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A16Q9GZN6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A16Q9GZN6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC6A16Q9GZN6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A16Q9GZN6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC6A16Q9GZN6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC6A16Q9GZN6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A16Q9GZN6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A16Q9GZN6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC6A16Q9GZN6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A16Q9GZN6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A16Q9GZN6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC6A16Q9GZN6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A16Q9GZN6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A16Q9GZN6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC6A16Q9GZN6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC6A16Q9GZN6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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