Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CFAP74Q9C0B2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CFAP74Q9C0B2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CFAP74Q9C0B2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CFAP74Q9C0B2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CFAP74Q9C0B2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CFAP74Q9C0B2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CFAP74Q9C0B2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CFAP74Q9C0B2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CFAP74Q9C0B2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CFAP74Q9C0B2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CFAP74Q9C0B2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CFAP74Q9C0B2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CFAP74Q9C0B2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CFAP74Q9C0B2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CFAP74Q9C0B2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CFAP74Q9C0B2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
CFAP74Q9C0B2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CFAP74Q9C0B2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CFAP74Q9C0B2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CFAP74Q9C0B2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CFAP74Q9C0B2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CFAP74Q9C0B2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CFAP74Q9C0B2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CFAP74Q9C0B2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CFAP74Q9C0B2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CFAP74Q9C0B2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CFAP74Q9C0B2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CFAP74Q9C0B2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CFAP74Q9C0B2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
CFAP74Q9C0B2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CFAP74Q9C0B2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CFAP74Q9C0B2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CFAP74Q9C0B2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
CFAP74Q9C0B2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CFAP74Q9C0B2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
CFAP74Q9C0B2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CFAP74Q9C0B2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CFAP74Q9C0B2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CFAP74Q9C0B2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CFAP74Q9C0B2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CFAP74Q9C0B2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CFAP74Q9C0B2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CFAP74Q9C0B2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CFAP74Q9C0B2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CFAP74Q9C0B2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CFAP74Q9C0B2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CFAP74Q9C0B2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CFAP74Q9C0B2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CFAP74Q9C0B2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CFAP74Q9C0B2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CFAP74Q9C0B2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
CFAP74Q9C0B2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CFAP74Q9C0B2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CFAP74Q9C0B2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CFAP74Q9C0B2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
CFAP74Q9C0B2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
CFAP74Q9C0B2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CFAP74Q9C0B2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CFAP74Q9C0B2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CFAP74Q9C0B2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CFAP74Q9C0B2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CFAP74Q9C0B2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CFAP74Q9C0B2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CFAP74Q9C0B2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CFAP74Q9C0B2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CFAP74Q9C0B2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CFAP74Q9C0B2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CFAP74Q9C0B2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CFAP74Q9C0B2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CFAP74Q9C0B2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CFAP74Q9C0B2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CFAP74Q9C0B2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CFAP74Q9C0B2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
CFAP74Q9C0B2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
CFAP74Q9C0B2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
CFAP74Q9C0B2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CFAP74Q9C0B2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CFAP74Q9C0B2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
CFAP74Q9C0B2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
CFAP74Q9C0B2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
CFAP74Q9C0B2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CFAP74Q9C0B2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CFAP74Q9C0B2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms