Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
KRTAP9-3Q9BYQ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP9-3Q9BYQ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP9-3Q9BYQ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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