Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP8

PAPPA2, Pappalysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA2Q9BXP8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PAPPA2Q9BXP8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PAPPA2Q9BXP8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PAPPA2Q9BXP8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
PAPPA2Q9BXP8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PAPPA2Q9BXP8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PAPPA2Q9BXP8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PAPPA2Q9BXP8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PAPPA2Q9BXP8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PAPPA2Q9BXP8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PAPPA2Q9BXP8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PAPPA2Q9BXP8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PAPPA2Q9BXP8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PAPPA2Q9BXP8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PAPPA2Q9BXP8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PAPPA2Q9BXP8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PAPPA2Q9BXP8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PAPPA2Q9BXP8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PAPPA2Q9BXP8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PAPPA2Q9BXP8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PAPPA2Q9BXP8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PAPPA2Q9BXP8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PAPPA2Q9BXP8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PAPPA2Q9BXP8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PAPPA2Q9BXP8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PAPPA2Q9BXP8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PAPPA2Q9BXP8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PAPPA2Q9BXP8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PAPPA2Q9BXP8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PAPPA2Q9BXP8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PAPPA2Q9BXP8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PAPPA2Q9BXP8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PAPPA2Q9BXP8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PAPPA2Q9BXP8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PAPPA2Q9BXP8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PAPPA2Q9BXP8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PAPPA2Q9BXP8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PAPPA2Q9BXP8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PAPPA2Q9BXP8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PAPPA2Q9BXP8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PAPPA2Q9BXP8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PAPPA2Q9BXP8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PAPPA2Q9BXP8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PAPPA2Q9BXP8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PAPPA2Q9BXP8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PAPPA2Q9BXP8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PAPPA2Q9BXP8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PAPPA2Q9BXP8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PAPPA2Q9BXP8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PAPPA2Q9BXP8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PAPPA2Q9BXP8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PAPPA2Q9BXP8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PAPPA2Q9BXP8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PAPPA2Q9BXP8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PAPPA2Q9BXP8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PAPPA2Q9BXP8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PAPPA2Q9BXP8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PAPPA2Q9BXP8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PAPPA2Q9BXP8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PAPPA2Q9BXP8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PAPPA2Q9BXP8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PAPPA2Q9BXP8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PAPPA2Q9BXP8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PAPPA2Q9BXP8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PAPPA2Q9BXP8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PAPPA2Q9BXP8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PAPPA2Q9BXP8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PAPPA2Q9BXP8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PAPPA2Q9BXP8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PAPPA2Q9BXP8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PAPPA2Q9BXP8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PAPPA2Q9BXP8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PAPPA2Q9BXP8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PAPPA2Q9BXP8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PAPPA2Q9BXP8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PAPPA2Q9BXP8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PAPPA2Q9BXP8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PAPPA2Q9BXP8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PAPPA2Q9BXP8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PAPPA2Q9BXP8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PAPPA2Q9BXP8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PAPPA2Q9BXP8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PAPPA2Q9BXP8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PAPPA2Q9BXP8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PAPPA2Q9BXP8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PAPPA2Q9BXP8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PAPPA2Q9BXP8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PAPPA2Q9BXP8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PAPPA2Q9BXP8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PAPPA2Q9BXP8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PAPPA2Q9BXP8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PAPPA2Q9BXP8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PAPPA2Q9BXP8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PAPPA2Q9BXP8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PAPPA2Q9BXP8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PAPPA2Q9BXP8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PAPPA2Q9BXP8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PAPPA2Q9BXP8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PAPPA2Q9BXP8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PAPPA2Q9BXP8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms