Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCRT1Q9BWW7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCRT1Q9BWW7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCRT1Q9BWW7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCRT1Q9BWW7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCRT1Q9BWW7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCRT1Q9BWW7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCRT1Q9BWW7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCRT1Q9BWW7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCRT1Q9BWW7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCRT1Q9BWW7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCRT1Q9BWW7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCRT1Q9BWW7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCRT1Q9BWW7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCRT1Q9BWW7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCRT1Q9BWW7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCRT1Q9BWW7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCRT1Q9BWW7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCRT1Q9BWW7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCRT1Q9BWW7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCRT1Q9BWW7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCRT1Q9BWW7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCRT1Q9BWW7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCRT1Q9BWW7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCRT1Q9BWW7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCRT1Q9BWW7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCRT1Q9BWW7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCRT1Q9BWW7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCRT1Q9BWW7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCRT1Q9BWW7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCRT1Q9BWW7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCRT1Q9BWW7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCRT1Q9BWW7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCRT1Q9BWW7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCRT1Q9BWW7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCRT1Q9BWW7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRT1Q9BWW7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRT1Q9BWW7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCRT1Q9BWW7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCRT1Q9BWW7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCRT1Q9BWW7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCRT1Q9BWW7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCRT1Q9BWW7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms