Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HIGD2AQ9BW72 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIGD2AQ9BW72 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIGD2AQ9BW72 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HIGD2AQ9BW72 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD2AQ9BW72 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD2AQ9BW72 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms