Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSG1Q9BU20 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSG1Q9BU20 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSG1Q9BU20 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSG1Q9BU20 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSG1Q9BU20 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSG1Q9BU20 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSG1Q9BU20 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RSG1Q9BU20 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RSG1Q9BU20 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSG1Q9BU20 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSG1Q9BU20 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RSG1Q9BU20 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSG1Q9BU20 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSG1Q9BU20 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RSG1Q9BU20 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RSG1Q9BU20 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RSG1Q9BU20 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RSG1Q9BU20 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RSG1Q9BU20 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSG1Q9BU20 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RSG1Q9BU20 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSG1Q9BU20 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RSG1Q9BU20 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSG1Q9BU20 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSG1Q9BU20 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSG1Q9BU20 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSG1Q9BU20 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSG1Q9BU20 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RSG1Q9BU20 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSG1Q9BU20 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSG1Q9BU20 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSG1Q9BU20 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSG1Q9BU20 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSG1Q9BU20 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSG1Q9BU20 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSG1Q9BU20 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSG1Q9BU20 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RSG1Q9BU20 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RSG1Q9BU20 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RSG1Q9BU20 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSG1Q9BU20 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RSG1Q9BU20 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSG1Q9BU20 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSG1Q9BU20 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RSG1Q9BU20 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms