Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINS3Q9BRX5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GINS3Q9BRX5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS3Q9BRX5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GINS3Q9BRX5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GINS3Q9BRX5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GINS3Q9BRX5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GINS3Q9BRX5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GINS3Q9BRX5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINS3Q9BRX5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GINS3Q9BRX5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GINS3Q9BRX5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINS3Q9BRX5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GINS3Q9BRX5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS3Q9BRX5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS3Q9BRX5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms