Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HINFPQ9BQA5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HINFPQ9BQA5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HINFPQ9BQA5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HINFPQ9BQA5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HINFPQ9BQA5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HINFPQ9BQA5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HINFPQ9BQA5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HINFPQ9BQA5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HINFPQ9BQA5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HINFPQ9BQA5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HINFPQ9BQA5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HINFPQ9BQA5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HINFPQ9BQA5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HINFPQ9BQA5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HINFPQ9BQA5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HINFPQ9BQA5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HINFPQ9BQA5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HINFPQ9BQA5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HINFPQ9BQA5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HINFPQ9BQA5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HINFPQ9BQA5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HINFPQ9BQA5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HINFPQ9BQA5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HINFPQ9BQA5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HINFPQ9BQA5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HINFPQ9BQA5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HINFPQ9BQA5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HINFPQ9BQA5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HINFPQ9BQA5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HINFPQ9BQA5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
HINFPQ9BQA5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HINFPQ9BQA5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HINFPQ9BQA5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HINFPQ9BQA5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HINFPQ9BQA5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HINFPQ9BQA5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HINFPQ9BQA5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HINFPQ9BQA5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HINFPQ9BQA5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HINFPQ9BQA5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HINFPQ9BQA5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HINFPQ9BQA5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HINFPQ9BQA5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HINFPQ9BQA5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HINFPQ9BQA5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HINFPQ9BQA5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HINFPQ9BQA5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HINFPQ9BQA5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HINFPQ9BQA5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HINFPQ9BQA5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HINFPQ9BQA5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HINFPQ9BQA5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HINFPQ9BQA5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HINFPQ9BQA5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HINFPQ9BQA5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HINFPQ9BQA5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HINFPQ9BQA5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HINFPQ9BQA5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HINFPQ9BQA5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HINFPQ9BQA5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HINFPQ9BQA5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HINFPQ9BQA5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HINFPQ9BQA5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HINFPQ9BQA5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HINFPQ9BQA5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HINFPQ9BQA5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
HINFPQ9BQA5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HINFPQ9BQA5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HINFPQ9BQA5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms